自西元20XX年，人 类从肯亚图尔卡纳湖的湖畔挖出了一个 名叫索哈尔(Zohar)的物体 之后，便开始对它进行研究，后来有人重建出来所谓的“神之语言 ”，并建立电脑程式以启动原始索哈尔 ，进行和上位领域的 U-DO(上位领域当中的红色波动存 在)连结的连结实验，但很不幸地，从 上位领域流入 下位领域的能量造成了事象变移，使地球(游戏中所谓的 “失落耶 路撒冷”)几乎完从从宇宙 中“消失”，人类因而被迫逃亡，离 开地球。 & nbsp ; ; ; &n bsp; &nbs p; &nbs p; &nb sp; & nbsp; &nb sp; &nbs p; ; &nbs p; &n bsp; &n bsp; 到了四千年多 后，在故事开始前十五的T.C.4 753年，米尔奇 亚行星(M iltia)爆发了所谓的米尔奇亚冲突事件，在此次事件当 中，米尔奇亚行星的人类疑 似遭到了格诺西斯(Gnosis)的攻击， 并在冲突事件后消失 ，但事件的真相却因为米尔奇亚的消失而不为人知。 在事件后，启动原始索哈 尔（后来人类制 造出了十二具索哈 尔模拟体，因此原有的索哈尔就被称之为原始索哈尔）所需的神之语言、原始索哈 尔的研究成果、米尔奇 亚的U.M. N.座标等事物，都被封存在Y资料 当中，而Y资料又被封存在百式观测用 合成人(Relian)M.O.M.O.的意识内，然而这么做却 引起了各方势 力对M.O.M.O.的争夺，因此星团联邦政府(游戏中统治各行星的政府，英文名Galaxy Federation) 雇了一个名叫Ziggurat 8的 生化人(Cyborg) ，以保护M.O.M.O.的安全。 &nb sp; &nbs p; &nb sp; &n bsp; &nb sp; & nbsp; &n bsp; ; ; &n bsp; &nbs p; &nb sp; 另一方面，在 米尔奇亚冲突事件结束后的十几年，也就是大约在游戏EPI开始的时候，当时最 大的企业贝克达公司以对抗格诺西斯侵扰 的名义，进 行对格诺西斯用战斗兵器KOS-MOS的开 发计划，但和当时多使 用合成人(Relian )与生化人(Cyborg)的情况所不同的是，KO S-MOS是个纯粹的机械制品。另一方面，在EPI开始时，参与KOS-MOS开发计划的贝克达公 司第一开发局研究人员卯月紫苑，正乘着当 时载有还没正 式启动的KOS-MOS的Woglinde号太空船进行旅 途。但没想到其太空船却被冲著索哈 尔而来的格诺西斯所攻击， 而KOS-MOS也在此时突然启动 ，卯月紫苑因而被卷入 一连串和格诺西 斯及索哈尔有关的阴谋，以及会改变人类 命运的事 件当中……
精彩剧情/对白：“何萍，你你，可 别是嫁不出去了？我这今年及笄呢，都已经许了人家了，再 看看你，都老了，怎么还没有人来 提亲。要 是实在嫁不出去，要不要我让我未婚夫那里帮你找找，实在不行，找个老点的也没事啊， 你看看你的脸，你也别老是 心高气傲了， 有人愿意娶就不错了。”
“妙玉姐姐不是这个意思，妙玉姐 姐的意思是，邵阳将军立下军功，乃是三品的邵阳将军。在朝廷，也是国家栋梁。而身为邵阳将军的夫人，什么都不会，岂不是给邵阳 将军扯后腿了。京城的这些夫人们，就算不是琴棋书画好皆好的，也有骑射好的，甚至还有茶 艺好的，总有拿得 出手的。而您什么都不 会，是不是就没有资格 了呢？”
“看在你这么配合的份上，我再告诉 你一个事情。你若是想要和我们大炎 联姻的话，你最好自己开口，认定了要娶明惠郡 主。否则，大炎 可能会随便在 臣子家里找一位姐， 封了郡主，嫁给你为太子妃，到时候，你可就没处哭了....”
“千亦年过四十，前面的夫人早亡，如今的夫人便是你娘。可是千亦膝 下，无儿无女的，依着这样的情况， 那是要从族里过继 孩子承欢膝下的。今年，我 们丛家安排孩子，任由千亦来选要过继那个，但是千亦百般阻扰，不愿意 过继。”
“我与自己的丫鬟在逛着， 一个人冲过来与我话 ，随后突然动手，我的丫鬟 还没有来得及反应，我也只是下意识的护着自己 ，那人却当 场暴毙了，街上的百姓很多，很快便造成了围堵 ，随后便闹 到了大理寺 ，我便被大理寺带走，现在皇上传唤我过
